home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Software Vault: The Diamond Collection / The Diamond Collection (Software Vault)(Digital Impact).ISO / cdr16 / med9505a.zip / M9550140.TXT < prev    next >
Text File  |  1995-03-04  |  2KB  |  34 lines
  1.        Document 0140
  2.  DOCN  M9550140
  3.  TI    Secondary structure in solution of two anti-HIV-1 hammerhead ribozymes
  4.        as investigated by two-dimensional 1H 500 MHz NMR spectroscopy in water.
  5.  DT    9505
  6.  AU    Sarma RH; Sarma MH; Rein R; Shibata M; Setlik RS; Ornstein RL; Kazim AL;
  7.        Cairo A; Tomasi TB; Institute of Biomolecular Stereodynamics, State
  8.        University of New; York at Albany 12222.
  9.  SO    FEBS Lett. 1995 Jan 9;357(3):317-23. Unique Identifier : AIDSLINE
  10.        MED/95137114
  11.  AB    Two hammerhead chimeric RNA/DNA ribozymes (HRz) were synthesized in pure
  12.        form. Both were 30 nucleotides long, and the sequences were such that
  13.        they could be targeted to cleave the HIV-1 gag RNA. Named HRz-W and
  14.        HRz-M, the former had its invariable core region conserved, the latter
  15.        had a uridine in the invariable region replaced by a guanine. Their
  16.        secodary structures were determined by 2D NOESY 1H 500 MHz NMR
  17.        spectroscopy in 90% water and 10% D2(0), following the imino protons.
  18.        The data show that both HRz-M and HRz-W form identical secondary
  19.        structures with stem regions consisting of continuous stacks of AT and
  20.        GT pairs. An energy minimized computer model of this stem region is
  21.        provided. The results suggest that the loss of catalytic activity that
  22.        is known to result when an invariant core residue is replaced is not
  23.        related to the secondary structure of the ribozymes in the absence of
  24.        substrate.
  25.  DE    Base Sequence  HIV-1/*DRUG EFFECTS  Molecular Sequence Data  Nuclear
  26.        Magnetic Resonance/*METHODS  *Protein Structure, Secondary  RNA,
  27.        Catalytic/*CHEMISTRY/PHARMACOLOGY  Solutions  Support, Non-U.S. Gov't
  28.        Support, U.S. Gov't, Non-P.H.S.  Support, U.S. Gov't, P.H.S.  JOURNAL
  29.        ARTICLE
  30.  
  31.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  32.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  33.  
  34.